陆地领土南北、东西延伸各270余千米。地势较高，仅北部边境的萨瓦河谷地和西南部内雷特瓦河流域略低。全国平均海拔693米。山地约占全国面积的90％。迪纳拉山脉自西北向东南贯穿全境，构成全国地形的主脊，主要由格尔梅奇山、奥谢切尼察山、卢涅瓦查山、迪纳拉山、维托罗格山、拉杜沙山等组成。

东南部边境地带的马格利奇山，海拔2386米，为全国最高点。北部沿萨瓦河延伸的低平地区，为多瑙河中游平原的南缘，是波黑富庶的农作区。河网较稠密，以迪纳拉山脉为分水岭，萨瓦河及其支流德里纳河、波斯尼亚河、弗尔巴斯河、乌纳河，属黑海流域水系。

交通运输以铁路和公路为主。1990年铁路总长1039千米，其中电气化铁路846千米。以多博伊为枢纽，干线南经泽尼察、莫斯塔尔，通克罗地亚港口普洛切。支线东达图兹拉，西经巴尼亚卢卡、比哈奇，折向南通克罗地亚港口斯普利特。

同年公路总长21168千米，其中现代化的等级公路11436千米。以萨拉热窝为枢纽，纵贯南北的公路干线与铁路干线并行，横穿东西的干线分别与南斯拉夫、克罗地亚的公路网联接。1993年有固定航班机场1处，即萨拉热窝国际机场。